技術路線

SSR實驗服務常見問題解答

1）公司可以做哪幾種熒光標記的檢測？

    我們采用ABI3730X Genetic Analyzer  對擴增片段進行毛細管電泳檢測，采用ROX500

作為分子量分析內標（紅色），PCR引物可以標記藍色（FAM）、綠色（HEX）、

黃色（NED），客戶只需提供引物序列，我們負責熒光引物的合成，同時根據擴增

片段的長度，設計引物組合、標記顏色組合，對多個位點復合擴增，同時檢測，以

便低成本高效的給客戶完成實驗。

2）SSR相關收費標準？

    按照實驗完整度，分以下幾種：

a.客戶提供提供相關實驗位點信息，我們完成整個實驗，其中包括引物篩選及后續全

部試驗，收費為：20元/反應（不包括引物合成費），熒光引物的合成300元/對（包

括上下游引物，熒光引物只標記其中一條）。b .客戶按照標記要求，送來的熒光引

物擴增后的PCR產物,收費為900元/板（96個樣，包括內標價格）。c .對于多個位點同

時檢測，如：4個位點，混合上樣，我們考慮到數據分析工作，每增加一個位點多100

元，即：4個位點，在原有基礎上增加了3個位點，共1200元。

3）是否可以提供全部檢測的峰圖？

    我們可以提供部分檢測峰圖，如：每個位點檢測到的等位基因對應的峰圖，因為

同一等位基因峰圖基本一致，所以不一一提供。

4）除了原始數據，一些常見遺傳多樣性分析參數是否可以提供？

    我們可以提供各位點檢測到的等位基因，等位基因頻率、多態信息含量（PIC）、期

望雜合度、觀察雜合度等常見的一些遺傳學參數。

5）對于一些未發表STR位點的物種，是否可以進行引物開發？

    對于未發表STR位點的物種，我們一般通過兩種方法進行STR引物的開發。第一，

從已發表的的近緣物種的SSR位點中篩選，多態性高，特異性好的SSR位點。但一般

特異性不好。第二，我們通過磁珠富集法篩選開發SSR引物，該方法篩選的引物物種

特異性較好，但實驗周期會長一些。

6）是否可以做SSR片段的回收克隆、測序？

     我們可以做STR的回收克隆測序，具體價格可協商。